漆黑的夜晚，一名间谍悄然潜入日本警方某机构，盗走了记载着各国谍报机构重要数据的绝密文件。日本警方和FBI探员赤井秀一立即与间谍展开追逐。最后，逃亡者的车辆坠落悬崖。第二天，柯南和伙伴们来到东都水族馆观光，结果发现一名受伤的美丽女子。该女子处于失忆状态，身上的手机也破损无法使用。柯南等人答应要帮她恢复记忆，当他们七嘴八舌之际，藏在暗处的黑衣组织成员贝尔摩德冷冷地注视着这一切。在相处过程中，女子非凡的身手和奇怪的言行举止让灰原哀对其真实身份产生怀疑。 刚刚还一派祥和的水族馆，沉浸在快乐之中的人们，根本不会想到

舞台：大阪&京都，正在录制"皐月杯"百人一首记者会的大阪地标·日卖电视台突然发生爆炸，千钧一发之际，急忙赶来的柯南救出了被困在崩塌大楼中的平次与和叶，而另一侧，"皐月杯"冠军在京都屋内遭人杀害，监控器里所显示出的是——红叶...原作中的重要角色，百人一首高中生冠军，自称"平次未婚妻"的大冈红叶，将首次在剧场版中登场，新一和小兰的关系也将发生变化....

《名侦探柯南 Episode "ONE"变小的名侦探》对《名侦探柯南》动画第1集“云霄飞车杀人事件”进行了详细的描述。工藤新一是全国非常著名的高中生侦探，他与他的青梅竹马毛利兰一起在游乐园游玩的时候遭遇了案件，在解决该案件的过程中，工藤新一发现了两名行动诡异的黑衣男子，便决定跟踪他们一看究竟。但是不幸被黑衣男子发现，黑衣男子将他击晕后，给他灌下了一种名叫“APTX4869”的神秘毒药，在毒药的副作用下，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的天才发明家阿笠博士，博士为

真实身份谜团重重、每个人都有着复杂背景的危险一家——赤井家族。在来叶崖假死的FBI探员赤井秀一，《名侦探柯南 绯色的不在证明》以他为中心展开，揭开了赤井秀一、世良真纯、羽田秀吉、玛丽等人的个性，以及他们几人之间的关系。故事的高潮则在讲述赤井秀一华丽复活的“绯色”系列。在某个事件中，赤井秀一的宿敌、代号为波本的安室透从FBI那打听到了“线索”。之后，安室透便深入调查赤井秀一与冲矢昴的关系。在经过了一系列的高智商攻防战后，赤井秀一的回归给所有人带来了冲击。而在这一连串的“不在场证明剧”的真相背后，都有着柯南的

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东京峰会召开在即，为了确保会议顺利进行，日本警方出动约两万名警力对位于东京湾的超大设施“海洋边缘”进行安保工作。可就在严密的防控下，此地已然发生了爆炸案。令柯南（高山南配音）等人始料未及的是，现场居然留下了对毛利小五郎（小山力也配音）极其不利的证据。在此之后，小五郎遭到逮捕。柯南则发现安室透曾出现在爆炸现场，并且负了伤。为了还毛利叔叔的清白，柯南和阿笠博士以及少年侦探团的小伙伴们联合起来勘察现场，搜集证据。随着调查的深入，柯南发现这起爆炸案隐藏着包括恐怖分子、公安在内多方的复杂关系，而真相更令所有人瞠目结

酒会现场发生山崎总经理被害事件。解决这个事件的是以福尔摩斯式的推理能力而声名大噪的高中生侦探——工藤新一。某天，新一和自己青梅竹马的同班同学毛利兰相约到游乐场游玩时，意外的在云霄飞车上遇到了杀人事件，在新一的推理下，很快协助警方破了这个案子。不过，这时有两个黑衣人的身影进入了新一的视线……

作为平成年代最后一部柯南电影，“名侦探柯南系列”首次将案件发生地设立在海外，基德时隔四年后再度回归，与柯南合体展开行动。故事围绕着19世纪末与海盗船一同沉入海底、世界上最大的蓝宝石“绀青之拳”展开。

本作是柯南第25部剧场版《名侦探柯南 万圣夜的新娘》的外传性质作品，回顾了高木涉和佐藤美和子之间的恋爱故事。最后附录的原创内容与《万圣夜的新娘》剧情相关，描绘了高木刑警和佐藤刑警婚礼前的样子。

《名侦探柯南：零的日常》改编自同名漫画，该故事的主人公是安室透，29岁，是一个混血儿，有着一头显眼的金发，以及小麦色的皮肤。安室透在白罗咖啡厅工作，而白罗咖啡厅的楼上是名侦探毛利小五郎的侦探事务所，安室透拜了毛利小五郎为师，成了一名私家侦探。然而，他的真实身份是潜入黑暗组织的公安警察，本名叫降谷零，他在黑暗组织中的代号为波本。拥有公安、侦探、黑暗组织成员三重面孔的安室透，擅长搜集情报，有着极强的观察力与推理能力，而且身手非常敏捷。他曾伪装成赤井来观察赤井秀一是否死亡，后来又对江户川柯南的身份产生了兴趣。这